澳門特別行政區於一九九九年十二月二十日的成立為澳門集郵引入了某些變更，特別是郵票發行當局的名稱以及郵票和小型張的識別編號。
首先，“葡萄牙共和國”的名稱即被“中國澳門”所取代；緊接著，舊編號系列在一九九九年十二月十九日發行了郵品 《澳門回顧》之後宣告終結，有關的最後幾個郵票編號分別為: S193（4/1）、S193（4/2）、S193（4/3）、S193（4/4）以及其小型張編號S194（1/1）。
在舊系列即將結束之際，我們不但對郵票和小型張建立了新的系列號和編號，而且對其他集郵產品亦如此辦理，如:首日封、小本票、資料單張、紀念封、明信片以及與新郵票發行相關的所有郵戳、紀念郵戳以及郵展郵戳。
所有的新系列編號均以001開始並以此順序往下排列。
澳門郵電決定建立以下將詳細介紹的新編號系統出於如下兩個目的:
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減低編號集郵產品的偽造可能性；
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以簡明和有效的方式，方便集郵者隨時核對其集郵品是否成套。
至於第一個減低世界範圍內的偽造行為的目的，萬國郵政聯盟（UPU）連同世界集郵發展協會（WADP）建立了郵票編號系統（WNS）。澳門郵電於二零零二年一月一日加入了該系統，其編號被批准以 MO xxx yy 標注。其中，“MO”意為澳門郵政當局；“xxx”為自001開始編號的編號之一； “yy”則為發行年份。
一般地，印於澳門郵電集郵產品上的編號，由識別產品的字母部分（如:S、B 等）與識別順序的序號部分（如:xxx = 001、002、003等）組成。
郵票和小型張還帶有一個附加標誌（y/z）。其中，可變標記“y”意為該套郵票的總枚數；可變標記“z”意為該枚郵票在其所屬整套郵票中的具體排行序號（請參閱隨後的解釋例子）。
| 以下為所使用的各種編號 |
|---|
| 發行郵品（郵票） |
S xxx（y/z） |
| 小型張/小全張 |
B xxx（y/z） |
| 連郵票之首日封 |
ENA xxx |
| 連小型張/小全張之首日封 |
ENB xxx |
| 郵電局發行之紀念封 |
ENC xxx |
| 其他機構發行之紀念封 |
ENX xxx |
| 空白資料單張 |
PGL xxx |
| 連郵票之小本票 |
BLK-S xxx（y/z） |
| 連小型張之小本票 |
BLK-B xxx（y/z） |
| 發行郵票之明信片 |
BPL xxx |
| 郵電局發行之紀念明信片 |
BPC xxx |
| 其他機構發行之紀念明信片 |
BPX xxx |
| 發行郵戳、紀念郵戳或郵展郵戳 |
C xxx |
為使集郵者和讀者更好地瞭解編號的使用方法和其意義，茲列舉如下範例:
| 澳門郵電之編號 |
|---|
| 編號 S216(4/1)﹕ |
意為澳門特別行政區成立之後的第二百一十六套郵票(216)，題為《中國戲曲 – 霸王別姬》，該套郵票共有四枚(4)，此為第一枚(1) 。
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| 編號 B192﹕ |
意為澳門特別行政區成立之後的第一百九十二枚小型張(192)，屬於發行《港珠澳大橋》。 |
| 編號 ENA222﹕ |
意為澳門特別行政區成立之後的第二百二十二個連郵票之首日封(222)，屬於發行《卡梅洛•庇山耶誕辰一百五十周年》。 |
| 編號 ENB196﹕ |
意為澳門特別行政區成立之後的第一百九十六個連小型張之首日封(196)，屬於發行《經典寓言故事》。 |
| 編號 PGL230﹕ |
意為澳門特別行政區成立之後的第二百三十張資料單張(230)，屬於發行《中華白海豚》。 |
| 編號 BPL220﹕ |
意為澳門特別行政區成立之後的第二百二十二張明信片(220)，屬於發行《蓮花》，題為“火炬”。 |
| 編號 C708﹕ |
意為澳門特別行政區成立之後的第七百零八個郵戳(708)，屬於發行《鳥語花香》。 |
| 萬國郵政聯盟和世界集郵發展協會之編號 |
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| 編號 MO007.17﹕ |
為澳門郵政當局在萬國郵政聯盟和世界集郵發展協會所登錄之二零一七年度第七枚郵票，屬於發行《鏡海歸帆圖》中的第一枚郵票。
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| 編號 MO010.18﹕ |
為澳門郵政當局在萬國郵政聯盟和世界集郵發展協會所登錄之二零一八年度第十枚郵票，屬於發行《澳門2018第35屆亞洲國際集郵展覽 (一)》中的小型張。
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為達至發展郵票文化和透過郵票宣傳澳門的目的，澳門郵電定將繼續提高郵票和郵品在各個方面的質量，如:選材、設計以及印製技術。