澳门特别行政区于一九九九年十二月二十日的成立为澳门集邮引入了某些变更，特别是邮票发行当局的名称以及邮票和小型张的识别编号。
首先，“葡萄牙共和国”的名称即被“中国澳门”所取代；紧接着，旧编号系列在一九九九年十二月十九日发行了邮品 《澳门回顾》之后宣告终结，有关的最后几个邮票编号分别为: S193（4/1）、S193（4/2）、S193（4/3）、S193（4/4）以及其小型张编号S194（1/1）。
在旧系列即将结束之际，我们不但对邮票和小型张建立了新的系列号和编号，而且对其他集邮产品亦如此办理，如:首日封、小本票、资料单张、纪念封、明信片以及与新邮票发行相关的所有邮戳、纪念邮戳以及邮展邮戳。
所有的新系列编号均以001开始并以此顺序往下排列。
澳门邮电决定建立以下将详细介绍的新编号系统出于如下两个目的:
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减低编号集邮产品的伪造可能性；
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以简明和有效的方式，方便集邮者随时核对其集邮品是否成套。
至于第一个减低世界范围内的伪造行为的目的，万国邮政联盟（UPU）连同世界集邮发展协会（WADP）建立了邮票编号系统（WNS）。澳门邮电于二零零二年一月一日加入了该系统，其编号被批准以 MO xxx yy 标注。其中，“MO”意为澳门邮政当局；“xxx”为自001开始编号的编号之一； “yy”则为发行年份。
一般地，印于澳门邮电集邮产品上的编号，由识别产品的字母部分（如:S、B 等）与识别顺序的序号部分（如:xxx = 001、002、003等）组成。
邮票和小型张还带有一个附加标志（y/z）。其中，可变标记“y”意为该套邮票的总枚数；可变标记“z”意为该枚邮票在其所属整套邮票中的具体排行序号（请参阅随后的解释例子）。
| 以下为所使用的各种编号 |
|---|
| 发行邮品（邮票） |
S xxx（y/z） |
| 小型张/小全张 |
B xxx（y/z） |
| 连邮票之首日封 |
ENA xxx |
| 连小型张/小全张之首日封 |
ENB xxx |
| 邮电局发行之纪念封 |
ENC xxx |
| 其他机构发行之纪念封 |
ENX xxx |
| 空白资料单张 |
PGL xxx |
| 连邮票之小本票 |
BLK-S xxx（y/z） |
| 连小型张之小本票 |
BLK-B xxx（y/z） |
| 发行邮票之明信片 |
BPL xxx |
| 邮电局发行之纪念明信片 |
BPC xxx |
| 其他机构发行之纪念明信片 |
BPX xxx |
| 发行邮戳、纪念邮戳或邮展邮戳 |
C xxx |
为使集邮者和读者更好地了解编号的使用方法和其意义，兹列举如下范例:
| 澳门邮电之编号 |
|---|
| 编号 S216(4/1)﹕ |
意为澳门特别行政区成立之后的第二百一十六套邮票(216)，题为《中国戏曲 – 霸王别姬》，该套邮票共有四枚(4)，此为第一枚(1) 。
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| 编号 B192﹕ |
意为澳门特别行政区成立之后的第一百九十二枚小型张(192)，属于发行《港珠澳大桥》。 |
| 编号 ENA222﹕ |
意为澳门特别行政区成立之后的第二百二十二个连邮票之首日封(222)，属于发行《卡梅洛•庇山耶诞辰一百五十周年》。 |
| 编号 ENB196﹕ |
意为澳门特别行政区成立之后的第一百九十六个连小型张之首日封(196)，属于发行《经典寓言故事》。 |
| 编号 PGL230﹕ |
意为澳门特别行政区成立之后的第二百三十张资料单张(230)，属于发行《中华白海豚》。 |
| 编号 BPL220﹕ |
意为澳门特别行政区成立之后的第二百二十二张明信片(220)，属于发行《莲花》，题为“火炬”。 |
| 编号 C708﹕ |
意为澳门特别行政区成立之后的第七百零八个邮戳(708)，属于发行《鸟语花香》。 |
| 万国邮政联盟和世界集邮发展协会之编号 |
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| 编号 MO007.17﹕ |
为澳门邮政当局在万国邮政联盟和世界集邮发展协会所登录之二零一七年度第七枚邮票，属于发行《镜海归帆图》中的第一枚邮票。
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| 编号 MO010.18﹕ |
为澳门邮政当局在万国邮政联盟和世界集邮发展协会所登录之二零一八年度第十枚邮票，属于发行《澳门2018第35届亚洲国际集邮展览 (一)》中的小型张。
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为达至发展邮票文化和透过邮票宣传澳门的目的，澳门邮电定将继续提高邮票和邮品在各个方面的质量，如:选材、设计以及印制技术。